Vacante de Técnico para Administración de Cluster de Bioinformática

Vacante de Técnico para Administración de Cluster de Bioinformática

DESCRIPCIÓN GENERAL:

Coordinar, colaborar, asistir y gestionar el soporte en la utilización de equipamientos y aplicaciones informáticas, de acuerdo con las directrices definidas por el puesto de trabajo, con el objetivo de ofrecer el mejor servicio.

FORMACIÓN ACADÉMICA, CONOCIMIENTOS Y EXPERIENCIA REQUERIDA:

• Titulación universitaria de grado medio, graduado universitario o superior.
• Experiencia comprobada en entornos de supercomputación relacionados con la bioinformática y la química teórica y computacional.
• Experiencia en administración de servidores de cálculo
• Familiarización con los compiladores gcc, intel y portland
• Familiarización con las librerías matemáticas MKL, FFTW3, LAPACK, BLAS
• Conocimientos sobre aplicaciones de cálculo químico como VASP, Gaussian, Molcas, Siesta, Gamess, ATK, ADF
• Conocimientos de MySQL
• Conocimientos de los servicios ganglia, icinga
• Conocimientos de IPTABLES
• Conocimientos de Windows, Linux y MacOS
• Familiarización en la instalación de aplicaciones compatibles con CUDA
• Conocimientos de la herramienta Modules
• Conocimientos de bash y tcsh y automatización de procesos
• Experiencia con redes infiniband
• Experiencia en la administración del sistema de archivo
• Experiencia en atención al usuario
• Conocimientos de virtualización ( Xen, Virtual Box, etc)
• Paralelización de aplicaciones mediante herramientas openmpi, mpich
• Experiencia en la realización de licitaciones públicas
• Conocimientos de idiomas (inglés, español).

FUNCIONES GENÉRICAS

• Capacidad de trabajo en equipo
• Colaborar y coordinar la planificación de las líneas de actuación técnicas de la Unidad
• Detectar y promover mejoras en el servicio, el equipamiento y la infraestructura
• Colaborar en la implementación de innovaciones en su ámbito y en la evaluación de su viabilidad
• Gestionar y colaborar en la realización de convocatorias de licitaciones públicas para la adquisición de material informático entre miembros de diferentes departamentos
• Asesorar en la adquisición de equipamientos científico-técnicos y en el diseño y funcionamiento de las instalaciones
• Realizar el seguimiento, coordinar y supervisar proveedores en la gestión de compras de equipamiento informático y de software relacionado con el ámbito de trabajo
• Colaborar en el diseño, despliegue y puesta a punto de nuevos clústeres de supercomputación
• Colaborar y coordinar la instalación, compilación y mantenimiento de aplicaciones informáticas en el ámbito de la química teórica y computacional y de los diferentes servicios asociados a la Unidad
• Montaje, instalación, mantenimiento y diagnóstico de averías de los equipos informáticos de supercomputación
• Gestión, mantenimiento, análisis, mejora y recuperación de los recursos informáticos (hardware y software) y de la infraestructura necesaria
• Administrar los servidores y servicios del ámbito de trabajo
• Gestionar y mantener usuarios de los sistemas y sus permisos de acceso a los servicios de la Unidad. Realización de copias de seguridad de los datos de usuario
• Gestionar, analizar, priorizar y resolver consultas e incidencias derivadas de las actividades del ámbito de trabajo y de sus usuarios
• Atender, informar y asesorar a los usuarios sobre el funcionamiento del clúster de supercomputación y buenas prácticas en relación con los servicios de la unidad
• Promover los servicios de la unidad y contribuir a la difusión de conocimiento a través de las redes sociales y listas de distribución
• Gestionar y mantener los servicios web y de redes sociales, así como las listas de distribución de la Unidad
• Control de inventario de los recursos materiales e informáticos de la unidad
• Elaborar informes, criterios de actuación, estudios, procedimientos de trabajo y manuales de ayuda en su ámbito de trabajo y promover el uso de herramientas que faciliten la gestión
• Realizar el seguimiento, colaborar y supervisar las operaciones e instalaciones realizadas por las empresas de mantenimiento
• Realizar otras funciones de contenido asimilable a las anteriores cuando sea necesario

FUNCIONES ESPECÍFICAS:

Habilidades críticas para mantenimiento del hardware:

• Gestionar físicamente la instalación, funcionamiento y actualización de los componentes de hardware que conforman el o los clústeres(s) del instituto, incluyendo tanto nodos CPU como GPU, memoria RAM, tarjetas NVidia, discos duros locales y servidor de almacenamiento, PDUs para conexión a gabinete y respaldo eléctrico.
• Instalación y gestión de las redes que conectan los componentes de procesamiento paralelo y posibles clústeres a lo interno y por acceso público (incluyendo Infiniband, switches, y otras capas de conexión a las redes regionales CLARA y BELLA II, según planes de la SENACYT).
• Monitoreo del funcionamiento del clúster (nagios, ganglia y software del proveedor de los clústeres) y de las demás variables operativas del local donde éste está instalado (temperatura, humedad, respaldo eléctrico etc.).
• Reparación de averías en el funcionamiento físico del clúster y sus componentes, en conjunto con el proveedor y los departamentos de IT y mantenimiento de INDICASAT.
• Apoyar con el mantenimiento preventivo de los clústeres incluyendo la adquisición de piezas de repuesto que es necesario mantener en stock para enfrentar averías comunes como fallos de discos del servidor de almacenamiento, memorias RAM individuales, etc.

Habilidades enfocadas a software:

• Instalación y mantenimiento de sistemas operativos Linux (CentOS, Rocky, Suse, Opensuse, Debian, Ubuntu, Redhat).
• Amplios conocimientos del sistema de colas (SLURM), incluyendo configuración avanzada y mantenimiento.
• Capacidad de optimización del software según las diferentes arquitecturas de los clústeres.
• Gestión de herramientas de virtualización (Xen, Virtual Box, etc.)  y sistemas contenedores que permitan instalar paquetes de software de todas las áreas de la bioinformática (Conda, Docker, Singularity, etc.)
• Gestión de servidores de cálculo gráfico (CUDA).
• Paralelización de aplicaciones mediante librerías MPI (openmpi, mpich).
• Uso de librerías matemáticas
• Capacidad de optimización del software según las diferentes arquitecturas de los clústeres
• Uso de shell scripting tanto para cálculo como para la realización de servicios y para la automatización de control del clúster y obtención de datos

Aplicación directa:

Si cuenta con el perfil solicitado, por favor enviar hoja de vida a la dirección de correo electrónico: kescobar@indicasat.org.pa

La experiencia previa y disposición para la plaza serán evaluadas mediante entrevista.