2do TALLER LATINOAMERICANO Y DEL CARIBE SOBRE SECUENCIACIÓN DE PRÓXIMA GENERACION DIRIGIDA PARA MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS RESISTENTE

ORGANIZADORES:  INDICASAT-AIP y LCRSP-ICGES

INTRODUCCION:

                  La tecnología de secuenciación de nueva generación (NGS) dirigida fusiona la amplificación selectiva de genes con la potencia de la secuenciación NGS. Esto permite la detección de resistencia a múltiples fármacos en una sola prueba. Al interrogar genes completos, la NGS dirigida identifica mutaciones específicas asociadas con la resistencia con una precisión superior a las técnicas de secuenciación de región amplia existentes. Además, la NGS detecta resistencia a fármacos nuevos y reutilizados que actualmente no son evaluados por ningún otro método molecular.  Por ejemplo, Deeplex® Myc-TB de illumina basada en la secuenciación masiva es una prueba todo en uno para la identificación, genotipado y predicción de la resistencia a los antibióticos a nivel de especie en cepas del complejo Mycobacterium tuberculosis

                  Recientemente, la Organización Mundial de la Salud impulsó las 1) guías consolidadas y 2) manual operativo de tuberculosis: Modulo 3 sobre diagnóstico rápido de tuberculosis1,2.  En estos documentos se aportan recomendaciones precisas para el uso de NGS dirigida al estudio de resistencias en una lista más amplia de medicamentos.  La guía recomienda el uso de NGS en pacientes con tuberculosis confirmada bacteriológicamente y tuberculosis resistente confirmada bacteriológicamente, salvo algunas condiciones.  Por tal motivo, resulta esencial la pronta implementación de NGS en los países de la región Latinoamericana y del Caribe

ALCANCE:

El taller sobre secuenciación de próxima generación dirigida (NGS) busca capacitar a laboratoristas de los laboratorios nacionales de referencia de tuberculosis de Latinoamérica y el Caribe. Además, científicos y estudiantes de Latinoamérica y el Caribe en el uso y aplicación de los métodos y plataforma para determinar las mutaciones puntuales de resistencias del Mycobacterium tuberculosis y conocer las experiencias regionales, aplicaciones actuales para salud pública e investigación y desarrollo. Este taller contará con la participación de expositores profesionales de laboratorios de referencia y de investigación científica de Latinoamérica. Cada especialista compartirá sus conocimientos y experiencias en uso de las herramientas NGS.

OBJETIVO GENERAL:

  • Facilitar a los participantes entrenamiento científico-técnica relevante sobre las plataformas NGS para el diagnóstico de tuberculosis resistente.

OBJETIVOS ESPECÍFICOS:

  1. Proporcionar habilidades prácticas en la realización de pruebas de NGS dirigido de Deeplex® Myc-TB de illumina
  2. Capacitar a los participantes en el análisis e interpretación de los resultados.

METODOLOGÍA

Este taller consistirá en 4 días de curso taller por expertos instructores en el tema y talleres prácticos.  Se incluyen sesiones de discusión de literatura y análisis de datos obtenidos. Los temas abarcan desde extracción de ADN, preparación de librerías, NGS dirigido, obtención y análisis de datos, e interpretación de los mismos.  El taller se realizará en los laboratorios de Genómica de INDICASAT-AIP en Ciudad del Saber, Panamá.

INSTRUCTORES:

  • Fermín Acosta – INDICASAT-AIP – PANAMÁ

  • Indira Quintero – INDICASAT-AIP – PANAMÁ

  • Samantha Rosas – LCRSP-GORGAS-PANAMÁ

  • Prudencio González – LCRSP-GORGAS-PANAMÁ

  • Luis Narvaez – INER-MEXICO

  • Christophe Sola – Université Paris-Saclay, FRANCE (virtual)

  • Jacobus de Waard – Universidad Central de Venezuela

  • Monserrath Rodríguez – Especialista de Genómica, illumina- AMERICA LATINA

FECHA:  4 – 7 de agosto del 2026, práctico, INDICASAT-AIP en Ciudad del Saber, República de Panamá.

HOSPEDAJE:   Hotel Holiday Inn Panamá Canal, Ciudad del Saber, Panamá. Tarifa especial para los aceptados en el taller.

APLICACION:  Cupos son limitados y debe llenar el formulario de aplicación en https://es.surveymonkey.com/r/3HRSLLJ

COSTO: la cuota requerida para el taller es:

  • Cuota reducida  275 USD al 30 de mayo
  • Cuota 375 USD al 30 de junio

Se aceptan pagos por VISA o transferencia bancaria a:

Banco Intermediario:

CITIBANK, N.A. – NEW YORK

SWIFT CITIUS33

ABA 021000089

Banco Beneficiario:

BANCO GENERAL, S.A. – PANAMA

SWIFT BAGEPAPA

Beneficiario Final:

INDICASAT-AIP

Número de cuenta Corriente: 0338010479052

MAYOR INFORMACIÓN: cursosytalleres@indicasat.org.pa

PATROCINADORES:

Agradecemos a Illumina y Biolab Internacional como patrocinadores con los costos de reactivos del DEEPLEX Myc-TB.

Escanea

PROGRAMA

TALLER CENTROAMERICANO Y DEL CARIBE SOBRE SECUENCIACIÓN DE PROXIMA GENERACION DIRIGIDA A MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS RESISTENTE.

Taller Deeplex del 04 al 07 agosto 2026
Hora

Martes 4 agosto
8:00 a 8:30 am Bienvenida: Breves Palabra INDICASAT, GORGAS, ILLUMINA
8:30 a 9:15 am Introducción a la secuenciación:

Secuenciación WGS

Secuenciación dirigida Deeplex

 ILLUMINA
9:15 a 9:45 am Revisión Protocolos:

Protocolo de extracción ADN

Protocolo PCR Deeplex

 GORGAS o INDICASAT
9:45 a 10:00 am Receso  
10:00 a 11:00 am PCR Deeplex (Laboratorio): 4 grupos de 3

 

 ILLUMINA, GORGAS, INDICASAT
11:00 A 12:00 Teoría:

Preparación de Librería, revisión de protocolos

 Illumina
1:00 a 4:00 pm Laboratorio: Limpieza y cuantificación de amplicones Deeplex ILLUMINA, GORGAS, INDICASAT

Día 2: miércoles 5 agosto
8:00 a 10:00 am Laboratorio: Preparación de Librería

Dilución del ADN

Tagmentación

Limpieza post Tagmentación

Amplificación post Tagmentación (Aproximadamente 55 min)

 ILLUMINA, GORGAS, INDICASAT
10:00 a 10:15 am Receso  
10:15 a 11:00 am Teoría

Segunda parte del protocolo preparación de Librería (Limpieza, cuantificación y desnaturalización)

Illumina
11:00 a 12:00 Laboratorio:

Limpieza final de librería

 ILLUMINA, GORGAS, INDICASAT
12:00 a 1:00 pm Almuerzo  
1:00 a 5:00 pm Laboratorio: Cuantificación librería y Phix

Desnaturalización de la librería

Preparación cartucho para secuenciar

 

 ILLUMINA, GORGAS, INDICASAT

Día 3 jueves 6 de agosto
8:00 a 10:00 Teoría Acceso Aplicación Deeplex WEB:

Creación de usuario

Análisis de datos: Carga de archivos Fastq para análisis de secuencias

Control de validación de los resultados

Receso

ILLUMINA
10:15 a 12:00 Revisión de resultados:

Detalles de los resultados

Calidad

Interpretación

Información taxonómica

Genes de detección y variantes

 ILLUMINA
12:00 a 1:00 pm Almuerzo  
1:00 a 5:00 pm Actividad extracurricular: Visitas a exclusas del Canal Mira Flores, Shopping Albrook Mall  

Dia 4: viernes 7 agosto
8:00 a 11:00 pm Parte Practica: Discusión de resultados

Cargar archivos Fastq a la plataforma Deeplex

análisis de las secuencias

Interpretación de los resultados

 ILLUMINA
11:00 a 12: 00 Clausura  

REFERENCES:

1 https://www.illumina.com/products/by-type/sequencing-kits/library-prep-kits/deeplex-myctb-combo-kit.html .

2WHO consolidated guidelines on tuberculosis. Module 3: diagnosis – rapid diagnostics for tuberculosis detection, third edition. Geneva: World Health Organization; 2024. Licence: CC BY-NC-SA 3.0 IGO.

3WHO operational handbook on tuberculosis. Module 3: diagnosis – rapid diagnostics for tuberculosis detection, third edition. Geneva: World Health Organization; 2024. Licence: CC BY-NC-SA 3.0 IGO.