Formación:
- Licenciatura en Bioquímica con énfasis en Bioinformática, Universidad de la Habana, Cuba.
- Doctorado en Biotecnología, Acharya Nagarjuna University/INDICASAT AIP.
Cargo:
Investigador/Científico de Plataforma en el área de Bioinformática, Instituto de Investigaciones Científicas y Servicios de Alta Tecnología (INDICASAT AIP).
Área de investigación
- Implementación de sistemas de computación científica de alto rendimiento para resolver problemas biológicos en las áreas de análisis de secuencias de ADN y bioinformática estructural.
- Genómica de microorganismos protozoarios y bacterianos causantes de enfermedades.
- Modelación molecular de la interacción de proteína-ligando con aplicación al diseño de nuevas vacunas y medicamentos.
Líneas de innovación e implementación metodológica
- Unidades de computación paralela de alto rendimiento para el análisis de datos biológicos.
- Sistemas computaciones táctiles para la visualización de la estructura 3D de las biomoléculas.
- Secuenciación, ensamblaje y anotación de genomas de microorganismos patógenos con aplicación a especies de Leishmania, Leptospira y Anaplasma, entre otros.
- Evolución molecular y filogenética aplicada a microorganismos causantes de enfermedades, incluyendo SARS-CoV-2 (COVID-19).
- Aplicación de estrategias predictivas para la identificación de epítopes de células B y T para el diseño de vacunas en el marco de la estrategia de vacunología inversa.
Colaboraciones
- Centro de Biología Celular y Molecular de Enfermedades de INDICASAT AIP, Panamá.
- Instituto Conmemorativo Gorgas de Estudios en Salud (ICGES), Panamá.
- Laboratorio Nacional de Transplante de la Caja de Seguro Social (CSS), Panamá.
- Escuela de Medicina Veterinaria, Universidad de Tennessee, Knoxville, TN, USA.
- Departamento de Química de la Universidad de Texas San Antonio, TX, USA.
Publicaciones seleccionadas
- Restrepo, CM, Llanes A, Herrera L., Ellis E., Lleonart R., Fernández PL (2021) Gene expression patterns associated with Leishmania panamensis infection in macrophages from BALB/c and C57BL/6 mice. PLOS Neg Trop Dis 15(2): e0009225.
- Llanes A, Cruz H, Nguyen VD, Larionov OV, Fernández PL (2021) A Computational Approach to Explore the Interaction of Semisynthetic Nitrogenous Heterocyclic Compounds with the SARS-CoV-2 Main Protease. Biomolecules 11(1):18.
- Llanes A, Ortiz L, Moscoso J, Gutierrez G, Blake E, Restrepo CM, Lleonart R, Cuero C, Vernaza-Kwiers A (2021) HLA allele and haplotype frequencies in the Panamanian population. Human Immunol 82(1):5-7.
- Herrera L, Llanes A, Álvarez J, Degracia K, Restrepo CM, Rivera R, Stephens DE, Dang HT, Larionov OL, Lleonart R, Fernández PL (2021) Antileishmanial activity of a new chloroquine analog in an animal model of Leishmania panamensis infection. Int J Parasitol Drugs Drug Resist 14:56-61.
- Llanes A, Restrepo CM, Caballero Z, Rajeev S, Kennedy MA, Lleonart R (2020) Betacoronavirus genomes: How genomic information has been used to deal with past outbreaks and the COVID-19 pandemic. Int J Mol Sci 21(12):4546.
- Llanes A, Prakoso D, Restrepo CM, Rajeev S (2020) Complete genome sequence of a virulent Leptospira interrogans serovar Copenhageni strain, assembled with a combination of Nanopore and Illumina reads. Microbiol Resour Announc 9(17):e00200-20.
- Llanes A, Rajeev S (2020) First whole genome sequence of Anaplasma platys, an obligate intracellular rickettsial pathogen of dogs. Pathogens 9(4):277.
- Restrepo CM, Llanes A, Cedeño EM, Chang JH, Álvarez, J, Ríos M, Penagos, H, Suárez JA, Lleonart, R (2019) Environmental conditions may shape the patterns of genomic variations in Leishmania panamensis. Genes 10(11), 838.
- Llanes A, Restrepo CM, Lleonart R (2018) VianniaTopes: a database of predicted immunogenic peptides for Leishmania (Viannia) species. Database 2018:bay111.
- González Y, Doens D, Cruz H, Santamaría R, Gutiérrez M, Llanes A, Fernández PL (2018) A Marine Diterpenoid Modulates the Proteasome Activity in Murine Macrophages Stimulated with LPS. Biomolecules 8(4), 109.
- Llanes A, Restrepo CM, Riesgo-Ferreiro P, Rajeev S (2018) Genomic variability among field isolates and laboratory-adapted strains of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo. J. Microbiol. 2018, 2137036.
- Llanes A, Restrepo CM, Rajeev S (2016) Whole genome sequencing allows better understanding of the evolutionary history ofLeptospira interrogansserovar Hardjo. PLoS ONE 11(7), e0159387.
- Restrepo CM, Llanes A, De La Guardia C, Lleonart R (2015) Genome-wide discovery and development of polymorphic microsatellites from Leishmania panamensis parasites circulating in central Panama. Vectors. 8, 527.
- Llanes A, Restrepo CM, Del Vecchio G, Anguizola FJ, Lleonart R (2015) The genome of Leishmania panamensis: insights into genomics of the (Viannia) subgenus. Sci. Rep. 5, 8550.
